藥師琉璃光如來本願功德經
香讚
爐香乍熱，法界蒙熏，諸佛海會悉遙聞，隨處結香雲，誠意方殷，諸佛現全身。
南無香雲蓋菩薩摩訶薩
香讚
爐香乍熱，法界蒙熏，諸佛海會悉遙聞，隨處結香雲，誠意方殷，諸佛現全身。
南無香雲蓋菩薩摩訶薩
淨口業真言
唵，修利，修利，摩訶修利，修修利，薩婆訶。
淨身業真言
唵,修哆利.修哆利.修摩利.修摩利.薩婆訶/
淨意業真言
唵，嚩日囉怛訶賀斛。
安土地真言
南摩三滿多 母馱喃 嗡 度嚕度嚕地尾薩婆訶
普供養真言
唵，誐誐曩，三婆嚩，襪日囉斛。
南摩三滿多 母馱喃 嗡 度嚕度嚕地尾薩婆訶
普供養真言
唵，誐誐曩，三婆嚩，襪日囉斛。
發願文
稽首三界尊，皈命十方佛，我今以宏願，持此藥師經，上報四重恩，下濟三塗苦，若有見聞者，悉發菩提心，盡此一報身，同生琉璃國。
稽首三界尊，皈命十方佛，我今以宏願，持此藥師經，上報四重恩，下濟三塗苦，若有見聞者，悉發菩提心，盡此一報身，同生琉璃國。
奉請十二藥叉大將
奉請：宮毗羅大將。奉請：伐折羅大將。
奉請：迷企羅大將。奉請：安底羅大將。
奉請：額你羅大將。奉請：珊底羅大將。
奉請：因達羅大將。奉請：波夷羅大將。
奉請：摩虎羅大將，奉請：真達羅大將。
奉請：招杜羅大將。奉請：毗羯羅大將
奉請八菩薩
奉請：文殊師利菩薩
奉請：觀世音菩薩
奉請：得大勢菩薩
奉請：無盡意菩薩
奉請：寶檀華菩薩
奉請：藥王菩薩
奉請：藥上菩薩
奉請：彌勒菩薩
南無藥師會上佛菩薩（三稱）
奉請：文殊師利菩薩
奉請：觀世音菩薩
奉請：得大勢菩薩
奉請：無盡意菩薩
奉請：寶檀華菩薩
奉請：藥王菩薩
奉請：藥上菩薩
奉請：彌勒菩薩
南無藥師會上佛菩薩（三稱）
開經偈
無上甚深微妙法，百千萬劫難遭遇，
我今見聞得受持，願解如來真實義。
藥師琉璃光如來本願功德經
唐三藏法師玄奘奉詔譯
如是我聞，一時薄伽梵，遊化諸國，至廣嚴城，住樂音樹下，與大苾蒭眾,八千人俱.菩薩摩訶薩.三萬六千,及國王大臣、婆羅門、居士、天龍八部、人非人等，無量大眾，恭敬圍繞，而為說法。爾時曼殊室利法王子，承佛威神，從座而起，偏袒一肩，右膝著地，向薄伽梵，曲躬合掌，白言，世尊，惟願演說如是相類諸佛名號。及本大願殊勝功德，令諸聞者，業障消除，為欲利樂像法轉時諸有情故，爾時世尊，讚曼殊室利童子言，善哉善哉，曼殊室利，汝以大悲，勸請我說諸佛名號，本願功德，為拔業障所纏有情，利益安樂.像法轉時諸有情故，汝今諦聽，極善思惟，當為汝說。曼殊室利言，唯然，願說，我等樂聞。
佛告曼殊室利，東方去此過十殑伽沙等佛土，有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來，應正等覺，明行圓滿，善逝世間解，無上士，調御丈夫，天人師、佛，薄伽梵，曼殊室利，彼世尊藥師琉璃光如來，本行菩薩道時，發十二大願，令諸有情，所求皆得。
第一大願：願我來世，得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明.熾然照耀.無量無數無邊世界，以三十二大丈夫相，八十隨形，莊嚴其身，令一切有情，如我無異。
第二大願：願我來世.得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過於日月，幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。
第三大願：願我來世.得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情，皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。
第四大願：願我來世.得菩提時，若諸有情，行邪道者，悉令安住菩提道中，若行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立之。
第五大願：願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中，修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒，設有毀犯，聞我名已，還得清淨.不墮惡趣。
第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，醜陋頑愚，盲聾喑啞，攣躄背僂，白癩癲狂，種種病苦，聞我名已，一切皆端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
第七大願，原我來世得菩提時，若諸有情，眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號，一經其耳，眾病悉除。身心安樂，家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
第八大願，原我來世得菩提時，若有女人，為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身，聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情，出魔罥網，解脫一切外道纏縛，若墮種種惡見稠林，皆當引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提。
第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情，王法所加，縛錄鞭撻，繫閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難淩辱，悲愁煎逼，身心受苦，若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
第十一大願，願我來世得菩提時，若諸有情，饑渴所惱，為求食故，造諸惡業，得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食，飽足其身，後以法味，畢竟安樂而建立之。
第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情，貧無衣服。蚊虻寒熱。晝夜逼惱，若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。
曼殊室利，是為彼世尊藥師琉璃如來，應正等覺行菩提道時，所發十二微妙上願。
復次曼殊室利，彼世尊藥師琉璃光如來，行菩薩道時，所發大願，及彼佛土功德莊嚴，我若一劫，若一劫餘，說不能盡，然彼佛土，一向清淨，無有女人，亦無惡趣，及苦音聲。琉璃為地，金繩界道，城闕宮閣，軒窗羅網，皆七寶成，亦如西方極樂世界，功德莊嚴，等無差別，於其國中，有二菩薩摩訶薩，一名日光遍照，二名月光遍照。是彼無量無數菩薩眾之上首，次補佛處，悉能持彼世尊..藥師琉璃光如來.正法寶藏，是故曼殊室利，諸有信心善男子，善女人等，應當願生彼佛世界。
爾時世尊，復告曼殊師利童子言，曼殊師利，有諸眾生，不識善惡，唯懷貪吝，不知布施，及施果報，愚癡無智，闕於信根，多聚財寶，勤加守護，見乞者來，其心不喜。設不獲已而行施時，如割身肉.深生痛惜，復有無量慳貪有情，積集資財，于其自身尚不受用，何況能與父母妻子，奴婢作使，及來乞者，彼諸有情，從此命終，生餓鬼界。
或傍生趣，由昔人間.曾得暫聞藥師琉璃光如來名故，今在惡趣，暫得憶念彼如來名，即于念時從彼處沒，還生人中，得宿命念，畏惡趣苦，不樂欲樂，好行惠施，讚歎施者。
一切所有，悉無貪惜，漸次尚能以頭目手足，血肉身分，施來求者，況餘財物/
復次曼殊師利，若諸有情，雖於如來受諸學處，而破尸羅，有雖不破尸羅，而破軌則,有于屍羅軌則雖得不壞，然毀正見，有雖不毀正見，而棄多聞，於佛所說契經深義，不能解了，有雖多聞，而增上慢，由增上慢，覆蔽心故，自是非他，嫌謗正法，為魔伴黨，如是愚人，自行邪見，復令無量具胝有情，墮大險坑，此諸有情，應於地獄傍生鬼趣，流轉無窮，若得聞此藥師琉璃光如來佛名號，便捨惡行修諸善法不墮惡趣，設有不能捨諸惡行.修行善法，墮惡趣者，以彼如來本願威力令其現前，蹔聞名號，從彼命終，還生人趣，得正見精進，善調意樂，便能捨家，趣於非家，如來法中，受持學處，無有毀犯，正見多聞，解甚深義，離增上慢，不謗正法，不為魔伴，漸次修行，諸菩薩行，速得圓滿。
復次曼殊室利，若諸有情，慳貪嫉妒，自讚毀他，當墮三惡趣中，無量千歲，受諸劇苦，受劇苦已，從彼命終，來生人間，作牛馬駝驢，恒被鞭撻，饑渴逼惱，又常負重，隨路而行，或得為人，生居下賤，作人奴婢，受他驅役，恒不自在，若昔人中，曾聞世尊藥師琉璃光如來名號，由此善因今復憶念，至心歸依，以佛神力，眾苦解脫，諸根聰利，智慧多聞，恒求勝法，常遇善友，永斷魔罥破無明殼。竭煩惱河，解脫一切生老病死，憂愁苦惱。
復次曼殊師利，若諸有情，好喜乖離，更相鬥訟，惱亂自他，以身語意，造作增長種種惡業，輾轉常為不饒益事，互相謀害，告召山林樹塚等神，殺諸眾生，取其血肉，祭祀藥叉羅刹婆等，書怨人名，作其形象，以惡咒術，而咒詛之，厭魅蠱道，咒起屍鬼，令斷彼命，及壞其身，是諸有情，若得聞此藥師琉璃光如來名號，彼諸惡事，悉不能害.一切輾轉皆起慈心，利益安樂，無損惱意及嫌恨心，各各歡悅，於自所受，生於喜足，不相侵陵，互為饒益。
復次曼殊室利，若有四眾比丘，比丘尼，烏波索迦，烏波斯迦，及餘淨信善男子，善女人等，有能受持八分齋戒，或經一年或復三月，受持學處，以此善根，願生西方極樂世界無量壽佛所。所聽聞正法，而未定者，若聞世尊樂師琉璃光如來名號，臨命終時，有八大菩薩，其名曰：文殊師利菩薩、觀世音菩薩、得大勢菩薩、無盡意菩薩、寶檀華菩薩、藥王菩薩、藥上菩薩、彌勒菩薩，是八大菩薩，乘空而來，示其道路，即於彼界，種種雜色，眾寶華中，自然化生，或有因此，生於天上，雖生天上，而本善根，亦未窮盡，不復更生，諸餘惡趣，天上壽盡，還生人間。或為輪王統攝四洲，威德自在。安立無量百千有情，於十善道或生刹帝利，婆羅門，居士大家，多饒財寶。倉庫盈溢，形相端正，眷屬具足，聰明智慧，勇健威猛，如大力士，若是女人，得聞世尊，藥師琉璃光如來名號，至心受持，於後不復更受女身。
復次曼殊室利，彼藥師琉璃光如來，得菩提時，由本願力，觀諸有情，遇眾病苦，瘦癵乾消，黃熱等病，或被厭魅蠱毒所中，或復短命，或時橫死，欲令是等病苦消除，所求願滿，時彼世尊，入三摩地，名曰：除滅一切眾生苦惱，既入定已，於肉髻中，出大光明，光中演說大陀羅尼曰 :
南謨薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕 薜琉璃缽喇婆喝囉闍也，怛他
爾時光中說此咒已，大地震動，放大光明，一切眾生，病苦皆除，受安隱樂，曼殊室利，若見男子女人，有病苦者，應當一心為彼病人，常清淨澡潄或食.或藥.或無蟲水.咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅，若有所求，至心念誦，皆得如是。無病延年，命終之後，生彼世界，得不退轉，乃至菩提。是故曼殊室利，若有男子女人，于彼藥師琉璃光如來，至心慇重，恭敬供養者，常持此咒，勿令廢忘。復次曼殊室利，若有淨信男子女人，得聞藥師琉璃光如來，應正等覺，所有名號，聞已誦持，晨嚼齒木，澡遫清淨，以諸香花，燒香塗香，作眾伎樂，供養形像，於此經典，若自書，若教人書，一心受持，聽聞其義，于彼法師，應修供養，一切所有，資身之具，悉皆施與，勿令乏少，如是便蒙諸佛護念，所求願滿，乃至菩提。
爾時曼殊室利童子白佛言，世尊，我當誓於像法轉時，以種種方便，令諸淨信，善男子善女人等，得聞世尊藥師琉璃樂如來名號，乃至睡中，亦以佛名，覺悟其耳。世尊，若於此經，受持讀誦，或復為他，演說開示，若自書，若教人書，恭敬尊重，以種種華香，塗香，粖香，燒香，花鬘，瓔珞，幡蓋，伎樂，而為供養，以五色彩，作囊盛之，掃灑淨處，敷設高座，而用安處。爾時四大天王，與其眷屬，及餘無量百千天眾，皆詣其所，供養守護。世尊，若此經寶流行之處，有能受持，以彼世尊藥師琉璃光如來本願功德，及聞名號，當知是處，無復橫死，亦復不為諸惡鬼神，奪其精氣，設已奪者，還得如故，身心安樂。佛告曼殊室利，如是如是。如汝所說。曼殊室利，若有淨信善男子，善女人等，欲供養彼世尊藥師琉璃光如來者，應先造立彼佛形像，敷清淨座，而安處之，散種種花，燒種種香，以種種幢幡，壯嚴其處，七日七夜，受八分齋戒，食清淨食，澡浴香潔，著清淨衣，應生無垢濁心，無怒害心，於一切有情，起利益安樂，慈悲喜捨平等之心，鼓樂歌讚，右繞佛像。復應念彼如來本願功德，讀誦此經，思惟其義，演說開示，隨所樂求，一切皆遂.求長壽得長壽，求富饒得富饒，求官位得官位，求男女得男女。若復有人，忽得惡夢，見諸惡相，或怪鳥來集，或於住處百怪出現，此人若以眾妙資具，恭敬供養，彼世尊藥師琉璃光如來者，惡夢惡相，諸不吉祥，皆悉隱沒，不能為患，或有水火，刀毒懸險，惡象獅子，虎狼熊羆，毒蛇惡蟹，蜈蚣蚰蜒，蚊蝱等怖，若能至心，憶念彼佛，恭敬供養，一切怖畏，皆得解脫，若他國侵擾，盜賊反亂，憶念恭敬，彼如來者，亦皆解脫。
復次曼殊室利，若有淨信善男子，善女人等，乃至盡形，不事餘天，唯當一心，歸佛法僧受持禁戒，若五戒，十戒，菩薩四百戒，比丘二百五十戒，比丘尼五百戒，於所受中，或有毀犯，怖墮惡趣。若能專念彼佛名號，恭敬供養者，必定不受三惡趣生，或有女人臨當產時，受於極苦，若能至心稱名禮讚，恭敬供養，彼如來者，眾苦皆除，所生之子，身分具足，形色端正，見者歡喜，利根聰明，安隱少病，無有非人，奪其精氣。
爾時世尊，告阿難言，如我稱揚，彼世尊，藥師琉璃光如來所有功德此是諸佛甚深行處，雖可解了，汝為信不。阿難白言，大德世尊，我於如來，所說契經，不生疑惑，所以者何，一切如來，身語意業，無不清淨。世尊，此明月輪，可令墮落，妙高山王，可使傾動，諸佛所言，無有異也..世尊。有諸眾生，信根不具，聞說諸佛，甚深行處，作是思惟，云何但念藥師琉璃光如來，一佛名號，便獲爾所功德勝利，由此不信，反生誹謗，彼於長夜，失大利樂。墮諸惡趣，流轉無窮，佛告阿難，是諸有情，若聞世尊藥師琉璃光如來名號，至心受持，不生疑惑，墮惡趣者，無有是處，阿難，此是諸佛，甚深所行，難可信解，汝今能受。當知皆是如來威力。阿難，一切聲聞獨覺，及未登地，諸菩薩等，皆悉不能如實信解。唯除一生，所繫菩薩。阿難，人身難得，於三寶中信敬尊重，亦難可得，聞世尊藥師琉璃光如來名號復難於是。阿難，彼藥師琉璃光如來，無量菩薩行，無量善巧方便，無量廣大願，我若一劫，若一劫餘，而廣說者，劫可速盡，彼佛行願，善巧方便，無有盡也。
爾時眾中。有一菩薩摩訶薩，名曰救脫，即從座起，偏袒右肩，右膝著地，曲躬合掌，而白佛言，大德世尊，像法轉時，有諸眾生，為種種患之所困厄，長病羸瘦，不能飲食，喉唇乾燥，見諸方暗，死相現前，父母親屬，朋友知識，啼泣圍繞，然彼自身，臥在本處，見琰魔使，引其神識，至於琰魔法王之前，然諸有情，有俱生神，隨其所作，若罪若福，皆具書之，盡持授予，琰魔法王，爾時彼王，推問其人，計算所作，隨其罪福而處斷之。時彼病人，親屬知識，若能為彼歸依世尊，藥師琉璃光如來，請諸眾僧，轉讀此經。燃七層之燈，懸五色續命神旛。或有是處，彼識得還，如在夢中，明了自見。或經七日，或二十一日，或三十五日，或四十九日，彼識還時，如從夢覺，皆自憶知善不善業，所得果報。
由自證見業果報故，及至命難，亦不造作諸惡之業。是故淨信善男子、善女人等，皆應受持藥師琉璃光如來名號，隨力所能，恭敬供養。”
爾時，阿難問救脫菩薩曰：“善男子應云何恭敬供養，彼世尊藥師琉璃光如來？續命旛燈，復云何造？”救脫菩薩言：“大德，若有病人，欲脫病苦，當為其人，七日七夜受持八分齋戒。應以飲食，及餘資具，隨力所辦，供養比丘僧，晝夜六時，禮拜行道。供養彼世尊藥師琉璃光如來，讀誦此經四十九遍，燃四十九燈，造彼如來形象七軀，一一像前，各置七燈，一一燈量，大如車輪，乃至四十九日，光明不絕。造五色彩旛長四十九搩手。應放雜類眾生至四十九。可得過度危厄之難，不為諸橫惡鬼所持。
復次，阿難，若刹帝利、灌頂王等，災難起時，所謂人中疾疫難，他國侵逼難，自界叛逆難，星宿變怪難，日月薄蝕難，非時風雨難，過時不雨難。 彼刹帝利、灌頂王等，爾時應於一切有情，起慈悲心，赦諸繫閉。依前所說供養之法，供養彼世尊藥師琉璃光如來。由此善根及彼如來本願力故，令其國界，即得安隱，風雨順時，穀稼成熟，一切有情，無病歡樂。于其國中，無有暴惡藥叉等神，惱有情者，一切惡相，皆即隱沒。而刹帝利、灌頂王等，壽命色力，無病自在，皆得增益。阿難，若帝后妃主，儲君王子，大臣輔相，中宮婇女，百官黎庶，為病所苦，及餘厄難，亦應造立五色神旛，燃燈續明，放諸生命，散雜色花，燒眾名香，病得除愈，眾難解脫。”
爾時，阿難問救脫菩薩言：“善男子，云何已盡之命，而可增益？”救脫菩薩言：“大德，汝豈不聞如來說有九橫死耶？是故勸造續命旛燈，修諸福德，以修福故，盡其壽命，不經苦患。”阿難問言：“九橫云何？”救脫菩薩言：“若諸有情，得病雖輕，然無醫藥，及看病者，設復遇醫，授以非藥，實不應死，而便橫死。又信世間邪魔外道妖孽之師，妄說禍福，便生恐動，心不自正，卜問覓禍，殺種種眾生，解奏神明，呼諸魍魎，請乞福佑，欲冀延年，終不能得。愚癡迷惑，信邪倒見，遂令橫死，入於地獄，無有出期，是名初橫。二者、橫被王法之所誅戮。三者、畋獵嬉戲，躭淫嗜酒，放逸無度，橫為非人奪其精氣。四者、橫為火焚。五者、橫為水溺。六者、橫為種種野獸所噉。七者、橫墮山崖。八者、橫為毒藥，厭禱咒詛，起屍鬼等之所中害。九者、饑渴所困，不得飲食，而便橫死。是為如來略說橫死有此九種。其餘復有無量諸橫，難可具說。
復次，阿難，彼琰魔王主領世間名籍之記，若諸有情，不孝五逆，破辱三寶，壞君臣法，毀於信戒。琰魔法王隨罪輕重，考而罰之。是故我今勸諸有情，燃燈造旛，放生修福，令度苦厄，不遭眾難。”
爾時，眾中有十二藥叉大將，俱在會座。所謂：宮毗羅大將，伐折羅大將，迷企羅大將，安底羅大將，額你羅大將，珊底羅大將，因達羅大將，波夷羅大將，摩虎羅大將，真達羅大將，招杜羅大將，毗羯羅大將。此十二藥叉大將，一一各有七千藥叉以為眷屬，同時舉聲白佛言：“世尊，我等今者蒙佛威力，得聞世尊藥師琉璃光如來名號，不復更有惡趣之怖。我等相率，皆同一心，乃至盡形，歸佛法僧，誓當荷負一切有情，為作義利，饒益安樂。隨于何等村城國邑，空閒林中，若有流布此經，或復受持藥師琉璃光如來名號，恭敬供養者，我等眷屬，衛護是人，皆使解脫一切苦難。諸有願求，悉令滿足。或有疾厄求度脫者，亦應讀誦此經，以五色縷，結我名字，得如願已，然後解結。”爾時，世尊讚諸藥叉大將言：“善哉，善哉，大藥叉將，汝等念報世尊藥師琉璃光如來恩德者，常應如是利益安樂一切有情。”
爾時，阿難白佛言：“世尊，當何名此法門，我等云何奉持？”佛告阿難：“此法門名說：藥師琉璃光如來本願功德；亦名說：十二神將，饒益有情，結願神咒；
亦名：拔除一切業障，應如是持。”時薄伽梵說是語已，諸菩薩摩訶薩，及大聲聞、國王大臣、婆羅門、居士、天龍、藥叉、乾闥婆、阿修羅、迦樓羅、緊那羅、摩雎羅伽、人非人等，一切大眾，聞佛所說，皆大歡喜，信受奉行。藥師琉璃光如來本願功德經
藥師灌頂真言
南無薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕，薜琉璃 ，缽喇婆，
喝囉闍也，怛他揭多耶，阿囉訶諦，三藐三勃陀耶，
怛侄他，唵，鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭諦，莎婆訶。
解冤咒
解結解結解冤結，解了多生冤和業，
洗心滌慮發虔誠，今對佛前求解結。
藥師佛，藥師佛，消災延壽藥師佛，隨心滿願藥師佛。
消解病咒
唵室哩哆,室哩哆暉吒唎,莎婆訶。
十二藥叉大將。助佛宣揚。五色彩縷結其名。
隨願悉圓成。冤業冰清。福壽 永康寧。
藥師教主。延壽能仁。日光普照月光臨。
菩薩降福隆。藥叉神明。擁護保安寧。
藥師會上。熾盛光王。十二大願妙難量。
苦海作舟航。
七佛護壇場。日月威光滅罪免災殃。藥師大願。
功德無邊。大千沙界盡包含。寶地布金蓮。我佛弘宣。福壽廣增延。
南無藥師海會佛菩薩摩訶薩
南無藥師海會佛菩薩摩訶薩
南無藥師海會佛菩薩摩訶薩
回向偈
願消三障諸煩惱, 願得智慧真明瞭,
普願罪障悉消除, 世世常行菩薩道。
無上甚深微妙法，百千萬劫難遭遇，
我今見聞得受持，願解如來真實義。
藥師琉璃光如來本願功德經
唐三藏法師玄奘奉詔譯
如是我聞，一時薄伽梵，遊化諸國，至廣嚴城，住樂音樹下，與大苾蒭眾,八千人俱.菩薩摩訶薩.三萬六千,及國王大臣、婆羅門、居士、天龍八部、人非人等，無量大眾，恭敬圍繞，而為說法。爾時曼殊室利法王子，承佛威神，從座而起，偏袒一肩，右膝著地，向薄伽梵，曲躬合掌，白言，世尊，惟願演說如是相類諸佛名號。及本大願殊勝功德，令諸聞者，業障消除，為欲利樂像法轉時諸有情故，爾時世尊，讚曼殊室利童子言，善哉善哉，曼殊室利，汝以大悲，勸請我說諸佛名號，本願功德，為拔業障所纏有情，利益安樂.像法轉時諸有情故，汝今諦聽，極善思惟，當為汝說。曼殊室利言，唯然，願說，我等樂聞。
佛告曼殊室利，東方去此過十殑伽沙等佛土，有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來，應正等覺，明行圓滿，善逝世間解，無上士，調御丈夫，天人師、佛，薄伽梵，曼殊室利，彼世尊藥師琉璃光如來，本行菩薩道時，發十二大願，令諸有情，所求皆得。
第一大願：願我來世，得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明.熾然照耀.無量無數無邊世界，以三十二大丈夫相，八十隨形，莊嚴其身，令一切有情，如我無異。
第二大願：願我來世.得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過於日月，幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。
第三大願：願我來世.得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情，皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。
第四大願：願我來世.得菩提時，若諸有情，行邪道者，悉令安住菩提道中，若行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立之。
第五大願：願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中，修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒，設有毀犯，聞我名已，還得清淨.不墮惡趣。
第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，醜陋頑愚，盲聾喑啞，攣躄背僂，白癩癲狂，種種病苦，聞我名已，一切皆端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
第七大願，原我來世得菩提時，若諸有情，眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號，一經其耳，眾病悉除。身心安樂，家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
第八大願，原我來世得菩提時，若有女人，為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身，聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情，出魔罥網，解脫一切外道纏縛，若墮種種惡見稠林，皆當引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提。
第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情，王法所加，縛錄鞭撻，繫閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難淩辱，悲愁煎逼，身心受苦，若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
第十一大願，願我來世得菩提時，若諸有情，饑渴所惱，為求食故，造諸惡業，得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食，飽足其身，後以法味，畢竟安樂而建立之。
第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情，貧無衣服。蚊虻寒熱。晝夜逼惱，若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。
曼殊室利，是為彼世尊藥師琉璃如來，應正等覺行菩提道時，所發十二微妙上願。
復次曼殊室利，彼世尊藥師琉璃光如來，行菩薩道時，所發大願，及彼佛土功德莊嚴，我若一劫，若一劫餘，說不能盡，然彼佛土，一向清淨，無有女人，亦無惡趣，及苦音聲。琉璃為地，金繩界道，城闕宮閣，軒窗羅網，皆七寶成，亦如西方極樂世界，功德莊嚴，等無差別，於其國中，有二菩薩摩訶薩，一名日光遍照，二名月光遍照。是彼無量無數菩薩眾之上首，次補佛處，悉能持彼世尊..藥師琉璃光如來.正法寶藏，是故曼殊室利，諸有信心善男子，善女人等，應當願生彼佛世界。
爾時世尊，復告曼殊師利童子言，曼殊師利，有諸眾生，不識善惡，唯懷貪吝，不知布施，及施果報，愚癡無智，闕於信根，多聚財寶，勤加守護，見乞者來，其心不喜。設不獲已而行施時，如割身肉.深生痛惜，復有無量慳貪有情，積集資財，于其自身尚不受用，何況能與父母妻子，奴婢作使，及來乞者，彼諸有情，從此命終，生餓鬼界。
或傍生趣，由昔人間.曾得暫聞藥師琉璃光如來名故，今在惡趣，暫得憶念彼如來名，即于念時從彼處沒，還生人中，得宿命念，畏惡趣苦，不樂欲樂，好行惠施，讚歎施者。
一切所有，悉無貪惜，漸次尚能以頭目手足，血肉身分，施來求者，況餘財物/
復次曼殊師利，若諸有情，雖於如來受諸學處，而破尸羅，有雖不破尸羅，而破軌則,有于屍羅軌則雖得不壞，然毀正見，有雖不毀正見，而棄多聞，於佛所說契經深義，不能解了，有雖多聞，而增上慢，由增上慢，覆蔽心故，自是非他，嫌謗正法，為魔伴黨，如是愚人，自行邪見，復令無量具胝有情，墮大險坑，此諸有情，應於地獄傍生鬼趣，流轉無窮，若得聞此藥師琉璃光如來佛名號，便捨惡行修諸善法不墮惡趣，設有不能捨諸惡行.修行善法，墮惡趣者，以彼如來本願威力令其現前，蹔聞名號，從彼命終，還生人趣，得正見精進，善調意樂，便能捨家，趣於非家，如來法中，受持學處，無有毀犯，正見多聞，解甚深義，離增上慢，不謗正法，不為魔伴，漸次修行，諸菩薩行，速得圓滿。
復次曼殊室利，若諸有情，慳貪嫉妒，自讚毀他，當墮三惡趣中，無量千歲，受諸劇苦，受劇苦已，從彼命終，來生人間，作牛馬駝驢，恒被鞭撻，饑渴逼惱，又常負重，隨路而行，或得為人，生居下賤，作人奴婢，受他驅役，恒不自在，若昔人中，曾聞世尊藥師琉璃光如來名號，由此善因今復憶念，至心歸依，以佛神力，眾苦解脫，諸根聰利，智慧多聞，恒求勝法，常遇善友，永斷魔罥破無明殼。竭煩惱河，解脫一切生老病死，憂愁苦惱。
復次曼殊師利，若諸有情，好喜乖離，更相鬥訟，惱亂自他，以身語意，造作增長種種惡業，輾轉常為不饒益事，互相謀害，告召山林樹塚等神，殺諸眾生，取其血肉，祭祀藥叉羅刹婆等，書怨人名，作其形象，以惡咒術，而咒詛之，厭魅蠱道，咒起屍鬼，令斷彼命，及壞其身，是諸有情，若得聞此藥師琉璃光如來名號，彼諸惡事，悉不能害.一切輾轉皆起慈心，利益安樂，無損惱意及嫌恨心，各各歡悅，於自所受，生於喜足，不相侵陵，互為饒益。
復次曼殊室利，若有四眾比丘，比丘尼，烏波索迦，烏波斯迦，及餘淨信善男子，善女人等，有能受持八分齋戒，或經一年或復三月，受持學處，以此善根，願生西方極樂世界無量壽佛所。所聽聞正法，而未定者，若聞世尊樂師琉璃光如來名號，臨命終時，有八大菩薩，其名曰：文殊師利菩薩、觀世音菩薩、得大勢菩薩、無盡意菩薩、寶檀華菩薩、藥王菩薩、藥上菩薩、彌勒菩薩，是八大菩薩，乘空而來，示其道路，即於彼界，種種雜色，眾寶華中，自然化生，或有因此，生於天上，雖生天上，而本善根，亦未窮盡，不復更生，諸餘惡趣，天上壽盡，還生人間。或為輪王統攝四洲，威德自在。安立無量百千有情，於十善道或生刹帝利，婆羅門，居士大家，多饒財寶。倉庫盈溢，形相端正，眷屬具足，聰明智慧，勇健威猛，如大力士，若是女人，得聞世尊，藥師琉璃光如來名號，至心受持，於後不復更受女身。
復次曼殊室利，彼藥師琉璃光如來，得菩提時，由本願力，觀諸有情，遇眾病苦，瘦癵乾消，黃熱等病，或被厭魅蠱毒所中，或復短命，或時橫死，欲令是等病苦消除，所求願滿，時彼世尊，入三摩地，名曰：除滅一切眾生苦惱，既入定已，於肉髻中，出大光明，光中演說大陀羅尼曰 :
南謨薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕 薜琉璃缽喇婆喝囉闍也，怛他
爾時光中說此咒已，大地震動，放大光明，一切眾生，病苦皆除，受安隱樂，曼殊室利，若見男子女人，有病苦者，應當一心為彼病人，常清淨澡潄或食.或藥.或無蟲水.咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅，若有所求，至心念誦，皆得如是。無病延年，命終之後，生彼世界，得不退轉，乃至菩提。是故曼殊室利，若有男子女人，于彼藥師琉璃光如來，至心慇重，恭敬供養者，常持此咒，勿令廢忘。復次曼殊室利，若有淨信男子女人，得聞藥師琉璃光如來，應正等覺，所有名號，聞已誦持，晨嚼齒木，澡遫清淨，以諸香花，燒香塗香，作眾伎樂，供養形像，於此經典，若自書，若教人書，一心受持，聽聞其義，于彼法師，應修供養，一切所有，資身之具，悉皆施與，勿令乏少，如是便蒙諸佛護念，所求願滿，乃至菩提。
爾時曼殊室利童子白佛言，世尊，我當誓於像法轉時，以種種方便，令諸淨信，善男子善女人等，得聞世尊藥師琉璃樂如來名號，乃至睡中，亦以佛名，覺悟其耳。世尊，若於此經，受持讀誦，或復為他，演說開示，若自書，若教人書，恭敬尊重，以種種華香，塗香，粖香，燒香，花鬘，瓔珞，幡蓋，伎樂，而為供養，以五色彩，作囊盛之，掃灑淨處，敷設高座，而用安處。爾時四大天王，與其眷屬，及餘無量百千天眾，皆詣其所，供養守護。世尊，若此經寶流行之處，有能受持，以彼世尊藥師琉璃光如來本願功德，及聞名號，當知是處，無復橫死，亦復不為諸惡鬼神，奪其精氣，設已奪者，還得如故，身心安樂。佛告曼殊室利，如是如是。如汝所說。曼殊室利，若有淨信善男子，善女人等，欲供養彼世尊藥師琉璃光如來者，應先造立彼佛形像，敷清淨座，而安處之，散種種花，燒種種香，以種種幢幡，壯嚴其處，七日七夜，受八分齋戒，食清淨食，澡浴香潔，著清淨衣，應生無垢濁心，無怒害心，於一切有情，起利益安樂，慈悲喜捨平等之心，鼓樂歌讚，右繞佛像。復應念彼如來本願功德，讀誦此經，思惟其義，演說開示，隨所樂求，一切皆遂.求長壽得長壽，求富饒得富饒，求官位得官位，求男女得男女。若復有人，忽得惡夢，見諸惡相，或怪鳥來集，或於住處百怪出現，此人若以眾妙資具，恭敬供養，彼世尊藥師琉璃光如來者，惡夢惡相，諸不吉祥，皆悉隱沒，不能為患，或有水火，刀毒懸險，惡象獅子，虎狼熊羆，毒蛇惡蟹，蜈蚣蚰蜒，蚊蝱等怖，若能至心，憶念彼佛，恭敬供養，一切怖畏，皆得解脫，若他國侵擾，盜賊反亂，憶念恭敬，彼如來者，亦皆解脫。
復次曼殊室利，若有淨信善男子，善女人等，乃至盡形，不事餘天，唯當一心，歸佛法僧受持禁戒，若五戒，十戒，菩薩四百戒，比丘二百五十戒，比丘尼五百戒，於所受中，或有毀犯，怖墮惡趣。若能專念彼佛名號，恭敬供養者，必定不受三惡趣生，或有女人臨當產時，受於極苦，若能至心稱名禮讚，恭敬供養，彼如來者，眾苦皆除，所生之子，身分具足，形色端正，見者歡喜，利根聰明，安隱少病，無有非人，奪其精氣。
爾時世尊，告阿難言，如我稱揚，彼世尊，藥師琉璃光如來所有功德此是諸佛甚深行處，雖可解了，汝為信不。阿難白言，大德世尊，我於如來，所說契經，不生疑惑，所以者何，一切如來，身語意業，無不清淨。世尊，此明月輪，可令墮落，妙高山王，可使傾動，諸佛所言，無有異也..世尊。有諸眾生，信根不具，聞說諸佛，甚深行處，作是思惟，云何但念藥師琉璃光如來，一佛名號，便獲爾所功德勝利，由此不信，反生誹謗，彼於長夜，失大利樂。墮諸惡趣，流轉無窮，佛告阿難，是諸有情，若聞世尊藥師琉璃光如來名號，至心受持，不生疑惑，墮惡趣者，無有是處，阿難，此是諸佛，甚深所行，難可信解，汝今能受。當知皆是如來威力。阿難，一切聲聞獨覺，及未登地，諸菩薩等，皆悉不能如實信解。唯除一生，所繫菩薩。阿難，人身難得，於三寶中信敬尊重，亦難可得，聞世尊藥師琉璃光如來名號復難於是。阿難，彼藥師琉璃光如來，無量菩薩行，無量善巧方便，無量廣大願，我若一劫，若一劫餘，而廣說者，劫可速盡，彼佛行願，善巧方便，無有盡也。
爾時眾中。有一菩薩摩訶薩，名曰救脫，即從座起，偏袒右肩，右膝著地，曲躬合掌，而白佛言，大德世尊，像法轉時，有諸眾生，為種種患之所困厄，長病羸瘦，不能飲食，喉唇乾燥，見諸方暗，死相現前，父母親屬，朋友知識，啼泣圍繞，然彼自身，臥在本處，見琰魔使，引其神識，至於琰魔法王之前，然諸有情，有俱生神，隨其所作，若罪若福，皆具書之，盡持授予，琰魔法王，爾時彼王，推問其人，計算所作，隨其罪福而處斷之。時彼病人，親屬知識，若能為彼歸依世尊，藥師琉璃光如來，請諸眾僧，轉讀此經。燃七層之燈，懸五色續命神旛。或有是處，彼識得還，如在夢中，明了自見。或經七日，或二十一日，或三十五日，或四十九日，彼識還時，如從夢覺，皆自憶知善不善業，所得果報。
由自證見業果報故，及至命難，亦不造作諸惡之業。是故淨信善男子、善女人等，皆應受持藥師琉璃光如來名號，隨力所能，恭敬供養。”
爾時，阿難問救脫菩薩曰：“善男子應云何恭敬供養，彼世尊藥師琉璃光如來？續命旛燈，復云何造？”救脫菩薩言：“大德，若有病人，欲脫病苦，當為其人，七日七夜受持八分齋戒。應以飲食，及餘資具，隨力所辦，供養比丘僧，晝夜六時，禮拜行道。供養彼世尊藥師琉璃光如來，讀誦此經四十九遍，燃四十九燈，造彼如來形象七軀，一一像前，各置七燈，一一燈量，大如車輪，乃至四十九日，光明不絕。造五色彩旛長四十九搩手。應放雜類眾生至四十九。可得過度危厄之難，不為諸橫惡鬼所持。
復次，阿難，若刹帝利、灌頂王等，災難起時，所謂人中疾疫難，他國侵逼難，自界叛逆難，星宿變怪難，日月薄蝕難，非時風雨難，過時不雨難。 彼刹帝利、灌頂王等，爾時應於一切有情，起慈悲心，赦諸繫閉。依前所說供養之法，供養彼世尊藥師琉璃光如來。由此善根及彼如來本願力故，令其國界，即得安隱，風雨順時，穀稼成熟，一切有情，無病歡樂。于其國中，無有暴惡藥叉等神，惱有情者，一切惡相，皆即隱沒。而刹帝利、灌頂王等，壽命色力，無病自在，皆得增益。阿難，若帝后妃主，儲君王子，大臣輔相，中宮婇女，百官黎庶，為病所苦，及餘厄難，亦應造立五色神旛，燃燈續明，放諸生命，散雜色花，燒眾名香，病得除愈，眾難解脫。”
爾時，阿難問救脫菩薩言：“善男子，云何已盡之命，而可增益？”救脫菩薩言：“大德，汝豈不聞如來說有九橫死耶？是故勸造續命旛燈，修諸福德，以修福故，盡其壽命，不經苦患。”阿難問言：“九橫云何？”救脫菩薩言：“若諸有情，得病雖輕，然無醫藥，及看病者，設復遇醫，授以非藥，實不應死，而便橫死。又信世間邪魔外道妖孽之師，妄說禍福，便生恐動，心不自正，卜問覓禍，殺種種眾生，解奏神明，呼諸魍魎，請乞福佑，欲冀延年，終不能得。愚癡迷惑，信邪倒見，遂令橫死，入於地獄，無有出期，是名初橫。二者、橫被王法之所誅戮。三者、畋獵嬉戲，躭淫嗜酒，放逸無度，橫為非人奪其精氣。四者、橫為火焚。五者、橫為水溺。六者、橫為種種野獸所噉。七者、橫墮山崖。八者、橫為毒藥，厭禱咒詛，起屍鬼等之所中害。九者、饑渴所困，不得飲食，而便橫死。是為如來略說橫死有此九種。其餘復有無量諸橫，難可具說。
復次，阿難，彼琰魔王主領世間名籍之記，若諸有情，不孝五逆，破辱三寶，壞君臣法，毀於信戒。琰魔法王隨罪輕重，考而罰之。是故我今勸諸有情，燃燈造旛，放生修福，令度苦厄，不遭眾難。”
爾時，眾中有十二藥叉大將，俱在會座。所謂：宮毗羅大將，伐折羅大將，迷企羅大將，安底羅大將，額你羅大將，珊底羅大將，因達羅大將，波夷羅大將，摩虎羅大將，真達羅大將，招杜羅大將，毗羯羅大將。此十二藥叉大將，一一各有七千藥叉以為眷屬，同時舉聲白佛言：“世尊，我等今者蒙佛威力，得聞世尊藥師琉璃光如來名號，不復更有惡趣之怖。我等相率，皆同一心，乃至盡形，歸佛法僧，誓當荷負一切有情，為作義利，饒益安樂。隨于何等村城國邑，空閒林中，若有流布此經，或復受持藥師琉璃光如來名號，恭敬供養者，我等眷屬，衛護是人，皆使解脫一切苦難。諸有願求，悉令滿足。或有疾厄求度脫者，亦應讀誦此經，以五色縷，結我名字，得如願已，然後解結。”爾時，世尊讚諸藥叉大將言：“善哉，善哉，大藥叉將，汝等念報世尊藥師琉璃光如來恩德者，常應如是利益安樂一切有情。”
爾時，阿難白佛言：“世尊，當何名此法門，我等云何奉持？”佛告阿難：“此法門名說：藥師琉璃光如來本願功德；亦名說：十二神將，饒益有情，結願神咒；
亦名：拔除一切業障，應如是持。”時薄伽梵說是語已，諸菩薩摩訶薩，及大聲聞、國王大臣、婆羅門、居士、天龍、藥叉、乾闥婆、阿修羅、迦樓羅、緊那羅、摩雎羅伽、人非人等，一切大眾，聞佛所說，皆大歡喜，信受奉行。藥師琉璃光如來本願功德經
藥師灌頂真言
南無薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕，薜琉璃 ，缽喇婆，
喝囉闍也，怛他揭多耶，阿囉訶諦，三藐三勃陀耶，
怛侄他，唵，鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭諦，莎婆訶。
解冤咒
解結解結解冤結，解了多生冤和業，
洗心滌慮發虔誠，今對佛前求解結。
藥師佛，藥師佛，消災延壽藥師佛，隨心滿願藥師佛。
消解病咒
唵室哩哆,室哩哆暉吒唎,莎婆訶。
十二藥叉大將。助佛宣揚。五色彩縷結其名。
隨願悉圓成。冤業冰清。福壽 永康寧。
藥師教主。延壽能仁。日光普照月光臨。
菩薩降福隆。藥叉神明。擁護保安寧。
藥師會上。熾盛光王。十二大願妙難量。
苦海作舟航。
七佛護壇場。日月威光滅罪免災殃。藥師大願。
功德無邊。大千沙界盡包含。寶地布金蓮。我佛弘宣。福壽廣增延。
南無藥師海會佛菩薩摩訶薩
南無藥師海會佛菩薩摩訶薩
南無藥師海會佛菩薩摩訶薩
回向偈
願消三障諸煩惱, 願得智慧真明瞭,
普願罪障悉消除, 世世常行菩薩道。
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